Jean-Michel est en couple avec Mélodie Charest depuis 2021. Leur rencontre s'est faite par l'intermédiaire d'amis communs. Mélodie, éducatrice spécialisée, évolue loin des projecteurs du monde artistique.
En parlant de Jean-Michel Anctil, il fera son retour à l'animation de « Ça finit bien la semaine » dès l'automne, aux côtés de Julie Bélanger. L'émission célèbre déjà quinze ans de diffusion, une belle longévité qui marque le temps qui passe vite!